根据豫编〔２００５〕５９号、豫编办〔２００６〕１７９号和豫政文〔２００６〕２３９号文件精神，我院的深化改革工作进入了全面实施阶段，院属有关科研机构和机关处（室）进行了调整或更名。具体情况如下：

院小麦研究所更名为小麦研究中心；

院烟草研究所更名为烟草研究中心；

院农业经济信息研究所更名为农业经济与信息研究中心；

院科学实验中心更名为农业质量标准与检测技术研究中心；

院棉花油料作物研究所更名为经济作物研究所；

院土壤肥料研究所更名为植物营养与资源环境研究所；

院生物技术研究所撤销；

院科技开发处更名为科技成果示范推广处；

院人事教育处更名为组织人事教育处；

院计划财务处更名为财务基建处；

院老干部处更名为离退休人员工作处；

院监察室更名为监察审计室；

成立院现代农业科技试验示范基地管理与服务中心、河南省农作物新品种重点实验室和河南省动物免疫学重点实验室。

其它院属科研机构和机关处（室）的名称和职能不变。